الثلاثاء 8 يوليو ، 2014. - شارك فريق من الباحثين من معهد فال دي هبرون دي ريكيركا (VHIR) في تحقيق دولي تعرف على 518 بكتريا مجهرية جديدة ، غير معروفة تمامًا حتى الآن ، في الكائنات الحية الدقيقة البشرية (النباتات المعوية).
وسّع البحث ، الذي استخدم فيه العلماء مقاربة جديدة لتحليل المعلومات البيولوجية ، كتالوج الجينات الميكروبية المعروفة ، من 3 إلى 10 ملايين.
نتائج هذا البحث ، التي نشرت يوم الأحد من قبل مجلة Nature Biotechnology ، هي جزء من مشروع MetaHIT الأوروبي (Metagenomics Human Intestinal Tract) ، وهبت بمبلغ 11.4 مليون يورو لاستقصاء علاقة الميكروبيوم البشري بالصحة والمرض . معهد فال ديبرون دي ريكيركا (VHIR) هو واحد من 13 مشاركًا في هذا المشروع - والمركز الإسباني الوحيد - تحت إشراف الدكتور فرانسيسكو غوارنر ، الذي أوضح أن هذه العينات التي لم تدرسها جميعها عدد الأنواع غير المعروفة.
عينات من النباتات المعوية لبعض الأفراد لديها عدد قليل جدا من هذه الأنواع ، وعند تحليلها بالتفصيل ، رأوا أنها عينات من المرضى الذين يعانون من مرض كرون. وأعلن غوارنر أن "هذا يشير إلى أن هذه الأنواع ، التي لم تكن معروفة حتى الآن ، ربما تكون هي التي تحدث الفرق بين الكائنات الحية الدقيقة من الأشخاص الأصحاء والمرضى".
وفقا للباحث ، فإن هذه البيانات تفتح استراتيجيات لمحاولة استعادة هذه الأنواع من خلال التدخلات الغذائية: إدارة الألياف ، البريبايوتك التي تساعد على النمو الانتقائي لبعض الأنواع أو البروبيوتيك.
من المحتمل أن تكون هذه البكتيريا غير المعروفة باسم "البكتيريا الجيدة" لأنها ليست البكتيريا النموذجية التي تسبب العدوى ، كما أنها ليست معروفة أو معزولة من قبل. وفقا لجوارنر ، لا يمكن عزل البكتيريا المكتشفة لأنها "من المؤكد أنها لن تعيش خارج القولون من أجل الزرع".
أشار الشخص المسؤول عن عمل وباحث مجموعة VHIR للفيزيولوجيا والفيزيولوجيا المرضية الهضمية إلى أن الأنواع الجديدة المكتشفة "ليست قابلة للزراعة ، حساسة للغاية للأكسجين ، أي أنها اللاهوائية صارمة للغاية وتؤسس اعتمادًا كبيرًا على بيئتها البقاء على قيد الحياة. " وقال غوارنر "للسبب نفسه ، عندما ذهبنا إلى قواعد البيانات ، لم نعثر على أي أثر وحتى الآن لم نكن نعرف أي شيء عنها".
كان هذا الاكتشاف ممكنًا بفضل مقاربة جديدة لتحليل المعلومات الأحيائية التي سمحت لهذه الأنواع "بالظهور".
"حاليًا - وفقًا لجوارنر - 10٪ فقط من المواد الوراثية المتسلسلة معروفة بموثوقية 95٪. وهذا يترك مساحة رمادية ضخمة يجري العمل عليها الآن."
لقد كشفت الدراسة عن 741 نوعًا من أنواع الميتاجينوم المختلفة ، سميت باسم استحالة تعيين اسم لهم. عند التناقض مع قواعد البيانات ، رأى الباحثون أن 115 من هذه الأنواع كانت معروفة بالفعل ، في حين أن 518 غير معروفة ؛ 108 المتبقية معروفة جزئيا.
"نعلم الآن ما هو شكل جينوم هذه الأنواع الميتاجينية ولكن ليس أسمائهم وألقابهم" ، أوضح غوارنر.
هناك عدد قليل من الأنواع غير معروفة ، لكن جنسهم أو الأسرة التي ينتمون إليها ، ولا يمكن تصنيف حوالي 200 نوع من الأنواع الميتاجينية من تلك الموصوفة بأي طريقة ، لأن أكثر من 80٪ من جيناتهم غير معروفة تمامًا اليوم.
وفقا للعلماء ، فإن الكائنات الحية الدقيقة التي تعيش في البشر تبلغ حوالي 100 مليار ، أي أكثر بعشر مرات من إجمالي عدد الخلايا البشرية.
تشير النتائج الأولية لهذا المشروع نفسه ، في عام 2010 ، إلى 3300000 جينة مختلفة ، وترجمت إلى 20،000 وظيفة مختلفة ، 5000 منها غير معروفة تماما حتى الآن.
كل شخص لديه حوالي 600000 من هذه الجينات الميكروبية ويتكرر 300000 باستمرار بين جميع الأفراد. وقال غارنر: "في هذه الدراسة الجديدة ، تم ضرب الرقم بثلاثة ، وتم الوصول إلى 9899896 جينة مختلفة".
المصدر:
علامات:
الصحة العافية عائلة
وسّع البحث ، الذي استخدم فيه العلماء مقاربة جديدة لتحليل المعلومات البيولوجية ، كتالوج الجينات الميكروبية المعروفة ، من 3 إلى 10 ملايين.
نتائج هذا البحث ، التي نشرت يوم الأحد من قبل مجلة Nature Biotechnology ، هي جزء من مشروع MetaHIT الأوروبي (Metagenomics Human Intestinal Tract) ، وهبت بمبلغ 11.4 مليون يورو لاستقصاء علاقة الميكروبيوم البشري بالصحة والمرض . معهد فال ديبرون دي ريكيركا (VHIR) هو واحد من 13 مشاركًا في هذا المشروع - والمركز الإسباني الوحيد - تحت إشراف الدكتور فرانسيسكو غوارنر ، الذي أوضح أن هذه العينات التي لم تدرسها جميعها عدد الأنواع غير المعروفة.
عينات من النباتات المعوية لبعض الأفراد لديها عدد قليل جدا من هذه الأنواع ، وعند تحليلها بالتفصيل ، رأوا أنها عينات من المرضى الذين يعانون من مرض كرون. وأعلن غوارنر أن "هذا يشير إلى أن هذه الأنواع ، التي لم تكن معروفة حتى الآن ، ربما تكون هي التي تحدث الفرق بين الكائنات الحية الدقيقة من الأشخاص الأصحاء والمرضى".
"بكتيريا جيدة"
وفقا للباحث ، فإن هذه البيانات تفتح استراتيجيات لمحاولة استعادة هذه الأنواع من خلال التدخلات الغذائية: إدارة الألياف ، البريبايوتك التي تساعد على النمو الانتقائي لبعض الأنواع أو البروبيوتيك.
من المحتمل أن تكون هذه البكتيريا غير المعروفة باسم "البكتيريا الجيدة" لأنها ليست البكتيريا النموذجية التي تسبب العدوى ، كما أنها ليست معروفة أو معزولة من قبل. وفقا لجوارنر ، لا يمكن عزل البكتيريا المكتشفة لأنها "من المؤكد أنها لن تعيش خارج القولون من أجل الزرع".
أشار الشخص المسؤول عن عمل وباحث مجموعة VHIR للفيزيولوجيا والفيزيولوجيا المرضية الهضمية إلى أن الأنواع الجديدة المكتشفة "ليست قابلة للزراعة ، حساسة للغاية للأكسجين ، أي أنها اللاهوائية صارمة للغاية وتؤسس اعتمادًا كبيرًا على بيئتها البقاء على قيد الحياة. " وقال غوارنر "للسبب نفسه ، عندما ذهبنا إلى قواعد البيانات ، لم نعثر على أي أثر وحتى الآن لم نكن نعرف أي شيء عنها".
أنواع ميتاجينوم مختلفة
كان هذا الاكتشاف ممكنًا بفضل مقاربة جديدة لتحليل المعلومات الأحيائية التي سمحت لهذه الأنواع "بالظهور".
"حاليًا - وفقًا لجوارنر - 10٪ فقط من المواد الوراثية المتسلسلة معروفة بموثوقية 95٪. وهذا يترك مساحة رمادية ضخمة يجري العمل عليها الآن."
لقد كشفت الدراسة عن 741 نوعًا من أنواع الميتاجينوم المختلفة ، سميت باسم استحالة تعيين اسم لهم. عند التناقض مع قواعد البيانات ، رأى الباحثون أن 115 من هذه الأنواع كانت معروفة بالفعل ، في حين أن 518 غير معروفة ؛ 108 المتبقية معروفة جزئيا.
"نعلم الآن ما هو شكل جينوم هذه الأنواع الميتاجينية ولكن ليس أسمائهم وألقابهم" ، أوضح غوارنر.
هناك عدد قليل من الأنواع غير معروفة ، لكن جنسهم أو الأسرة التي ينتمون إليها ، ولا يمكن تصنيف حوالي 200 نوع من الأنواع الميتاجينية من تلك الموصوفة بأي طريقة ، لأن أكثر من 80٪ من جيناتهم غير معروفة تمامًا اليوم.
الشخص لديه 600000 الجينات الميكروبية
وفقا للعلماء ، فإن الكائنات الحية الدقيقة التي تعيش في البشر تبلغ حوالي 100 مليار ، أي أكثر بعشر مرات من إجمالي عدد الخلايا البشرية.
تشير النتائج الأولية لهذا المشروع نفسه ، في عام 2010 ، إلى 3300000 جينة مختلفة ، وترجمت إلى 20،000 وظيفة مختلفة ، 5000 منها غير معروفة تماما حتى الآن.
كل شخص لديه حوالي 600000 من هذه الجينات الميكروبية ويتكرر 300000 باستمرار بين جميع الأفراد. وقال غارنر: "في هذه الدراسة الجديدة ، تم ضرب الرقم بثلاثة ، وتم الوصول إلى 9899896 جينة مختلفة".
المصدر:
